Rachen- oder Nasopharyngealabstriche und -sekrete,
Sputum, Bronchiallavage,
SARS-CoV-2-positives-RNA-Eluat
(CT-Wert der qPCR < 25)

Erfolgreich ermittelte SARS-CoV-2-Lineage mittels Pangolin (https://pangolin.cog-uk.io/)

SARS-CoV-2-positive-Proben mit einem labordiagnostischen Verdacht auf das Vorliegen einer besorgniserregenden Variante (VOC) oder einer unter Beobachtung stehende Variante (VOI)

Proben, die einen der folgenden epidemiologischen Verdachtsmomente erfüllen:
- Impfdurchbrüche
- Verdacht auf Reinfektion
- Reiserückkehrer aus Risikogebieten
- Aufklärung eines komplexen Infektionsgeschehens (große Veranstaltungen, unerwartete Übertragungsmuster etc.)

Im Sinne der Coronavirus-Surveillanceverordnung (CorSurV) des Bundesministeriums für Gesundheit fördert die Bundesregierung die bundesweite Genomsequenzierung der Coronaviren mit dem Ziel, die Evolution und Ausbreitung des Coronavirus SARS-CoV-2 zu überwachen und das Auftreten neuer Varianten frühzeitig zu entdecken. Vor diesem Hintergrund werden die rekonstruierten SARS-CoV-2-Genomsequenzen dem Robert-Koch-Institut (RKI) über das Deutsche Elektronische Sequenzdaten-Hub (DESH) übermittelt.

Lediglich die SARS-CoV-2-Varianten Alpha (B.1.1.7), Alpha + E484K (B.1.1.7+ E484K), Beta (B.1.351), Gamma (P.1), Delta (B.1.617.2), Kappa (B.1.617.1) und Omikron (B.1.1.529) sind nach heutigem Stand mit einem erhöhten Infektionsrisiko assoziiert. Bei den Varianten Delta Plus (AY.1 (B.1.617.2.1) bis AY.130 (B.1.617.2.130)) und Omikron Plus (BA.1 (B.1.1.529.1) bis BA.5 (B.1.1.529.5)) wird ebenfalls ein erhöhtes Infektionsrisiko vermutet.